"Sihtfinantseerimine" projekt SF0270177As08
SF0270177As08 (SF0270177As08) "Inimpopulatsioonide globaalne struktureerumine: ränded, triiv ja valik (1.01.2008−31.12.2013)", Richard Villems, Eesti Biokeskus.
SF0270177As08
Inimpopulatsioonide globaalne struktureerumine: ränded, triiv ja valik
Global structuring of human populations: migrations, drift and selection
1.01.2008
31.12.2013
Teadus- ja arendusprojekt
Sihtfinantseerimine
ValdkondAlamvaldkondCERCS erialaFrascati Manual’i erialaProtsent
1. Bio- ja keskkonnateadused1.3. GeneetikaB220 Geneetika, tsütogeneetika 1.5. Bioteadused (bioloogia, botaanika, bakterioloogia, mikrobioloogia, zooloogia, entomoloogia, geneetika, biokeemia, biofüüsika jt50,0
2. Ühiskonnateadused ja kultuur2.3. Ajalooteadused ja arheoloogiaH341 Eelajalugu6.1. Ajalugu (üldajalugu, eelajalugu, arheoloogia, numismaatika, paleograafia, genealoogia jne.)30,0
3. Terviseuuringud3.11. Terviseuuringutega seotud uuringud, näiteks biokeemia, geneetika, mikrobioloogia, biotehnoloogia, molekulaarbioloogia, rakubioloogia, biofüüsika ja bioinformaatikaH361 Neurolingvistika 3.1. Biomeditsiin (anatoomia, tsütoloogia, füsioloogia, geneetika, farmaatsia, farmakoloogia, kliiniline keemia, kliiniline mikrobioloogia, patoloogia)20,0
AsutusRollPeriood
Eesti Biokeskuskoordinaator01.01.2008−31.12.2013
PerioodSumma
01.01.2008−31.12.20082 340 000,00 EEK (149 553,26 EUR)
01.01.2009−31.12.20092 149 632,00 EEK (137 386,52 EUR)
01.01.2010−31.12.20102 106 100,00 EEK (134 604,32 EUR)
01.01.2011−31.12.2011134 600,00 EUR
01.01.2012−31.12.2012163 890,00 EUR
01.01.2013−31.12.2013163 890,00 EUR
883 924,10 EUR

Inimpopulatsioonide globaalse struktureerituse selgitamine on inimkonna fülogeneesi rekonstrueerimise sõlmpunktiks ja eluliselt vajalik genotüübi-fenotüübi vahekorra edukaks selgitamiseks, sealjuures pidades silmas ka tavahaiguste geneetilisi põhjusi. Käesoleva projekti põhiliseks eesmärgiks on selgitada inimmgenoomi haploidse osa - mtDNA ja mitterekombineeruva Y kromosoomi osa ning autosoomsetes kromosoomides leitud polümorfismide globaalset varieeruvust. Selle saavutamiseks rekonstrueerime vastavate fülogeneetiliste puude topoloogiat, uurime oluliste klaadide fülogeograafiat ning kasutades molekulaarset kella ja koalestsentsiteooriat, selgitame klaadide ajalis-ruumilist teket ja dispersiooni. Haploidsete geneetiliste süsteemide uurimisest saadavat andmestikku, mis on samas ka mitmete tööhüpoteeside taustaks, püüame korrelleerida inimkonna autosoomsete geenide varieeruvuse uurimisega. Töös kasutatkse DNA sekveneerimist ning genoomi-ülest kõrgtihedat polümorfismide kaardistamist.
To understand clobal structuring of human populations is central for the reconstruction of the phylogeny of of mankind and vital for the understanding of genotype-phenotype correllations, including association studies to reveal genetics of common diseases. The main objective of the current project is to reveal the global pattern of variation of the haploid part of our genome - of the non-recombining part of the Y chromosome and mitochondrial DNA. To achieve that we plan to reconstruct topologies of the corresponding phylogenetic trees and using molecular clock and coalescence theory, to reveal temporal and spatial origin and spread of monophyletic clades. The obtained information serves as the source for working hypotheses to study global autosomal variation using whole genome association approach empoying high throughput, high density apprach.