See veebileht kasutab küpsiseid kasutaja sessiooni andmete hoidmiseks. Veebilehe kasutamisega nõustute ETISe kasutustingimustega. Loe rohkem
Olen nõus
"Eesti Teadusfondi uurimistoetus" projekt ETF8973
ETF8973 "Euraasia populatsioonide geneetiline struktuur ja kohastumine lokaalses keskkonnas arktika populatsioonide näitel. (1.01.2011−31.12.2014)", Mait Metspalu, Eesti Biokeskus.
ETF8973
Euraasia populatsioonide geneetiline struktuur ja kohastumine lokaalses keskkonnas arktika populatsioonide näitel.
The genetic structure of Eurasian populations and signals for local adaptations. A Case study of Circum Arctic populations.
1.01.2011
31.12.2014
Teadus- ja arendusprojekt
Eesti Teadusfondi uurimistoetus
ETIS klassifikaatorAlamvaldkondCERCS klassifikaatorFrascati Manual’i klassifikaatorProtsent
1. Bio- ja keskkonnateadused1.3. GeneetikaB220 Geneetika, tsütogeneetika 1.5. Bioteadused (bioloogia, botaanika, bakterioloogia, mikrobioloogia, zooloogia, entomoloogia, geneetika, biokeemia, biofüüsika jt100,0
AsutusRollPeriood
Eesti Biokeskuskoordinaator01.01.2011−31.12.2014
PerioodSumma
01.01.2011−31.12.201112 000,00 EUR
01.01.2012−31.12.201212 000,00 EUR
01.01.2013−31.12.201312 000,00 EUR
01.01.2014−31.12.201412 000,00 EUR
48 000,00 EUR

Kasutades kõrgtihedat ülegenoomset analüüsi, on uuringu eesmärgiks luua esimene ligilähedaselt representatiivne andmestik Arktika elanike kohta sügavusega ligikaudu 650 000 markerit indiviidi kohta. Plaanitud lähenemine haaraks rahvaid kogu Arktika - nii Vana kui Uue Maailma - ulatuses. Eeldame, et see võimaldab meil luua ettekujutuse Arktiliste rahvaste geneetilisest struktuurist ja annab võimaluse uurida erinevaid geneetilisi kohastumusi võrreldes inimestega, kes elavad mõõduka ja sooja kliima vööndeis.
The aim of this proposal is to create the first nearly comprehensive high-density whole genome genetic variation data set of Arctic people at the depth of about 650,000 markers per individual. The planned approach is essentially circum-Arctic, covering populations living both in the Old and the New World. We trust that it would allow to reveal a detailed pattern of genetic structure of Arctic people and opens possibilities to seek for different types of adaptations as compared to people living in temperate and warm aras of our planet.
Eelarves genotüpiseerimisele ettenähtud summa 4000€ lubas genotüpiseerida 10 indiviidi (Selkupid, Hakassid ja Dolgaanid) 650 000 SNP d. See on vaid väike osa meie laboris uuritud proovidest (kokku umbes 4000 tk). Nende proovide kompleksne analüüs võimaldas jõuda muuhulgas ka käesoleva projekti planeeritud tulemusteni. Kõiki genotüpiseeritud proove on analüüsitud geneetilise struktuuri suhtes kasutades Admixture, PCA ja teisi meetodeid. Pidades silmas selle projekti üht peaeesmärki, geneetiliste interaktsioonide ruumilist käsitlust Euraasia Parasvöötmes, on projekti tähtsaimateks tulemusteks Natures (2tk), PLoS ONEis ja AJHG-s avaldatud artiklid, mis käsitlevad vastavalt i) 24 tuhande aasta vanuse lõuna Siberist pärit genoomi järjestuse analüüsi, ning sealt johtuvat uudset põlis-ameeriklaste geenitiigi tekke kirjeldust ii) Ameerika demograafilist ajalugu läbi 11 000 aasta vanuse Clovise kultuuri kandja genoomi sekveneerimise ja tänapäevaste inimpopulatsioonide geneetilise varieeruvusega võrdlemise ning iii) Siberi populatsioonide külmataluvuse kohastumusi ja iiii) valikulist luuatõmmet kahjuliku alleeli kasuks CPT1A geenis Arktilistes populatsioonides.