"Eesti Teadusfondi uurimistoetus" projekt ETF8197
ETF8197 "Makroliidide toimemehhanismid (1.01.2010−31.12.2012)", Tanel Tenson, Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Tehnoloogiainstituut.
ETF8197
Makroliidide toimemehhanismid
The mechnaisms of macrolide action
1.01.2010
31.12.2012
Teadus- ja arendusprojekt
Eesti Teadusfondi uurimistoetus
ETIS klassifikaatorAlamvaldkondCERCS klassifikaatorFrascati Manual’i klassifikaatorProtsent
4. Loodusteadused ja tehnika4.9. MeditsiinitehnikaT410 Farmaatsiatooted ja nende tehnoloogiad 2.3. Teised tehnika- ja inseneriteadused (keemiatehnika, lennundustehnika, mehaanika, metallurgia, materjaliteadus ning teised seotud erialad: puidutehnoloogia, geodeesia, tööstuskeemia, toiduainete tehnoloogia, süsteemianalüüs, metallurgia, mäendus, tekstiilitehnoloogia ja teised seotud teadused).34,0
1. Bio- ja keskkonnateadused1.2. MikrobioloogiaB230 Mikrobioloogia, bakterioloogia, viroloogia, mükoloogia 1.5. Bioteadused (bioloogia, botaanika, bakterioloogia, mikrobioloogia, zooloogia, entomoloogia, geneetika, biokeemia, biofüüsika jt33,0
3. Terviseuuringud3.1. BiomeditsiinB510 Nakkushaigused3.1. Biomeditsiin (anatoomia, tsütoloogia, füsioloogia, geneetika, farmaatsia, farmakoloogia, kliiniline keemia, kliiniline mikrobioloogia, patoloogia)33,0
PerioodSumma
01.01.2010−31.12.2010192 000,00 EEK (12 271,04 EUR)
01.01.2011−31.12.201112 271,20 EUR
01.01.2012−31.12.201212 271,20 EUR
36 813,44 EUR

Makroliidid on laialt kasutatavad antibiootikumid. Need ühendid seonduvad ribosoomi suurele alaühikule, peatavad sünteesitava peptiidi kasvu ja põhjustavad peptidüül-tRNA dissotsiatsiooni ribosoomist. Makroliidide ribosoomile seondumise detailide selgitamiseks on kasutatud kristallstruktuuri uuringuid. Paraku ei ole organismid, kust ribosoomid on kristalliseeritud, patogeenid, tõstatades küsimuse makroliidide seondumisdetailide liigispetsiifilisusest. Käesolevas projektis plaanime mõõta mitme makroliidi seondumiskineetikat ribosoomidele, mis on pärit fülogeneetiliselt erinevatest bakteritest, kaasaarvatud patogeenidest. Selle uurimuse tulemused näitaksid kui suured on erinevused makroliidide seondumises eri päritolu ribosoomidele. Oma seondumiskohale jõudmiseks peavad makroliidid kõigepealt rakku sisenema. Rakku sisenemise parameetrite mõõtmiseks plaanime kasutada mikroskoopiat, jälgides fluorestsentsmärkega erütromütsiini derivaadi liikumist. Rakku sisenemise ja märklauale seondumise parameetreid, mida me mõõdame, kasutame meie poolt eelnevalt loodud makroliidide toime teoreetilise mudeli edasiarendamiseks.
Macrolides are widely used antibiotics. The drugs bind to the ribosomal large subunit, stop elongation of the nascent peptide chain and cause dissociation of the peptidyl-tRNA from the ribosome. The details of macrolide-ribosome complexes have been studied by crystal structure analysis. As the published complexes contain ribosomes from organisms that are not pathogens, it raises the concern about species specificity of the binding details. Here we propose to study the binding kinetics of several macrolides to ribosomes from several bacterial species, including the common pathogens. These studies should indicate how large are the differences of macrolide binding to different ribosomes. Before reaching their binding site the macrolides have to enter the bacterium. We propose studies on the antibiotic uptake parameters by tracking a fluorescently labeled erythromycin derivative with microscopy. The uptake and binding information will be used for updating our theoretical model of macrolide action.