"Sihtfinantseerimine" projekt SF0382147s02
SF0382147s02 "Biofüüsikalised elementaarprotsessid ja nende dünaamika (1.01.2002−31.12.2006)", Arvi Freiberg, Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Füüsika Instituut.
SF0382147s02
Biofüüsikalised elementaarprotsessid ja nende dünaamika
Biophysical elementary processes and their dynamics
1.01.2002
31.12.2006
Sihtfinantseerimine
ValdkondAlamvaldkondCERCS erialaFrascati Manual’i erialaProtsent
4. Loodusteadused ja tehnika4.10. FüüsikaP230 Aatomi- ja molekulaarfüüsika 1.2. Füüsikateadused (astronoomia ja kosmoseteadus, füüsika ja teised seotud teadused)50,0
1. Bio- ja keskkonnateadused1.12. Bio- ja keskkonnateadustega seotud uuringud, näiteks biotehnoloogia, molekulaarbioloogia, rakubioloogia, biofüüsika, majandus- ja tehnoloogiauuringudP330 Bioenergeetika 1.5. Bioteadused (bioloogia, botaanika, bakterioloogia, mikrobioloogia, zooloogia, entomoloogia, geneetika, biokeemia, biofüüsika jt50,0
PerioodSumma
01.01.2002−31.12.2002925 000,00 EEK (59 118,27 EUR)
01.01.2003−31.12.20031 021 000,00 EEK (65 253,79 EUR)
01.01.2004−31.12.20041 143 000,00 EEK (73 051,01 EUR)
01.01.2005−31.12.20051 143 000,00 EEK (73 051,01 EUR)
01.01.2006−31.12.20061 326 000,00 EEK (84 746,85 EUR)
355 220,93 EUR

"Teema sisuks on eksperimentaalsed ja teoreetilised uuringud järgmistes molekulaarse biofüüsika suundades: energia ja elektroni/prootoni ülekandeprotsessid dünaamiliselt aktiivses keskkonnas; ergastuse levi, muundumine ja haare fotosünteesis; polümeersed elektrolüüdid. Nimetatud põhiliselt baasteaduslike uuringute eesmärk on funktsionaalsete mehhanismide väljaselgitamine, aga samuti omandataval  teabel baseeruvad võimalikud praktilised rakendused. "
.

Vastutav täitja (1)

IsikKraadTöökoht ja ametCVOsalemise periood
Arvi FreibergdoktorikraadEST / ENG01.01.2006−31.12.2006

Põhitäitjad (12)

IsikKraadTöökoht ja ametCVOsalemise periood
Aleksandr EllerveedoktorikraadEST / ENG01.01.2002−31.12.2006
Aleksandr EllerveedoktorikraadEST / ENG01.01.2006−31.12.2006
Liina KangurdoktorikraadEST / ENG01.01.2002−31.12.2006
Liina KangurdoktorikraadEST / ENG01.01.2006−31.12.2006
Kristjan LeigerdoktorikraadEST / ENG01.01.2002−31.12.2006
Kristjan LeigerdoktorikraadEST / ENG01.01.2006−31.12.2006
Margus RätsepdoktorikraadEST / ENG01.01.2002−31.12.2006
Margus RätsepdoktorikraadEST / ENG01.01.2006−31.12.2006
Tarmo TammdoktorikraadEST / ENG01.01.2002−31.12.2006
Tarmo TammdoktorikraadEST / ENG01.01.2006−31.12.2006
Kõu TimpmanndoktorikraadEST / ENG01.01.2002−31.12.2006
Kõu TimpmanndoktorikraadEST / ENG01.01.2006−31.12.2006
Publikatsioonid
Publikatsioonid
Rätsep, M.; Freiberg, A. (2007). Unusual temperature quenching of Bacteriochlorophyll a fluorescence in FMO antenna protein trimers. Chemical Physics Letters, 434, 306−311.10.1016/j.cplett.2006.12.013.
Trinkunas, G.; Freiberg, A. (2006). A disordered polaron model for polarized fluorescence excitation spectra of LH1 and LH2 bacteriochlorophyll antenna aggregates. Journal of Luminescence, 119, 105−110.
Pettai, H.; Oja, V.; Freiberg, A.; Laisk, A. (2006). Response to the “Comments to water-splitting activity of Photosystem II by far-red light in green plants” by H.-W. Trissl. Biochimica et Biophysica Acta-Bioenergetics, 1757 (3), 158−159.
Trinkunas, G.; Freiberg, A. (2005). Abrupt exciton self-trapping in finite and disordered one-dimensional aggregates. Journal of Luminescence, 112, 420−423.
Ratsep, M.; Hunter, CN.; Olsen, JD.; Freiberg, A. (2005). Band structure and local dynamics of excitons in bacterial light-harvesting complexes revealed by spectrally selective spectroscopy. Photosynthesis Research, 86, 37−48.
Timpmann, K.; Trinkunas, G.; Qian, P.; Hunter, CN.; Freiberg, A. (2005). Excitons in core LH1 antenna complexes of photosynthetic bacteria: Evidence for strong resonant coupling and off-diagonal disorder. Chemical Physics Letters, 414, 359−363.
Pettai, H.; Oja, V.; Freiberg, A.; Laisk, A. (2005). Photosynthetic activity of far-red light in green plants. Biochimica et Biophysica Acta-Bioenergetics, 1708 (3), 311−321.
Pettai, H.; Oja, V.; Freiberg, A.; Laisk, A. (2005). The long-wavelength limit of plant photosynthesis. FEBS Letters, 579 (18), 4017−4019.
Tamm, T.; Linnanto, J; Ellervee, A.; Freiberg, A. (2005). Modeling pressure effects on absorption spectra of solvated chlorophyll and bacteriochlorophyll molecules. Lectures Series on Computer and computational Sciences, 3A. BRILL Academic Publishers, 550−553.
Timpmann, K.; Trinkunas, G.; Olsen, JD.; Hunter, CN.; Freiberg, A. (2004). Bandwidth of excitons in LH2 bacterial antenna chromoproteins. Chemical Physics Letters, 398, 384−388.
Freiberg, A.; Ratsep, M.; Timpmann, K.; Trinkunas, G. (2004). Dual fluorescence of single LH2 antenna nanorings. Journal of Luminescence, 108, 107−110.
Timpmann, K.; Ratsep, M.; Hunter, CN.; Freiberg, A. (2004). Emitting excitonic polaron states in core LH1 and peripheral LH2 bacterial light-harvesting complexes. The Journal of Physical Chemistry B, 108 (29), 10581−10588.
Ellervee, A.; Linnanto, J.; Freiberg, A. (2004). Spectroscopic and quantum chemical study of pressure effects on solvated chlorophyll. Chemical Physics Letters, 394, 80−84.
Gall, A.; Ellervee, A.; Robert, B.; Freiberg, A. (2004). The effect of internal voids in membrane proteins: high-pressure study of two photochemical reaction centres from Rhodobacter sphaeroides. FEBS Letters, 560, 221−225.
Gall, A.; Ellervee, A.; Sturgis, JN.; Fraser, NJ.; Cogdell, RJ.; Freiberg, A.; Robert, B. (2003). Membrane protein stability: High pressure effects on the structure and chromophore-binding properties of the light-harvesting complex LH2. Biochemistry, 42 (44), 13019−13026.
Ihalainen, JA.; Ratsep, M.; Jensen, PE.; Scheller, HV.; Croce, R.; Bassi, R.; Korppi-Tommola, JEI.; Freiberg, A. (2003). Red spectral forms of chlorophylls in green plant PSI - a site-selective and high-pressure spectroscopy study. The Journal of Physical Chemistry B, 107 (34), 9086−9093.
Ratsep, M.; Freiberg, A. (2003). Resonant emission from the B870 exciton state and electron-phonon coupling in the LH2 antenna chromoprotein. Chemical Physics Letters, 377, 371−376.
Freiberg, A.; Ratsep, M.; Timpmann, K.; Trinkunas, G. (2003). Self-trapped excitons in circular cacteriochlorophyll antenna complexes. Journal of Luminescence, 102, 363−368.
Freiberg, A.; Ratsep, M.; Timpmann, K.; Trinkunas, G.; Woodbury, NW. (2003). Self-trapped excitons in LH2 antenna complexes between 5 K and ambient temperature. The Journal of Physical Chemistry B, 107 (41), 11510−11519.
Timpmann, K.; Ellervee, A.; Kuznetsov, A.; Laisaar, A.; Trinkunas, G.; Freiberg, A. (2003). Self-trapped excitons in LH2 bacteriochlorophyll-protein complexes under high pressure. Journal of Luminescence, 102, 220−225.
Freiberg, A.; Ellervee, A.; Lõhmus, A.; Lõhmus, R.; Timpmann, K.; Trinkunas, G. (2003). Essential differences between the core and peripheral antenna excitons in photosynthetic purple bacteria revealed by high-pressure spectroscopy. In: Winter, R. (Ed.). Advances in High Pressure Bioscience and Biotechnology II (25−28).. Heidelberg: Springer.
Ellervee, E.; Freiberg, A. (2002). Pressure solvation of photosynthetic pigments. Defect and Diffusion Forum, 208 (2), 135−138.