"Riiklik programm: Humanitaar- ja loodusteduslikud kogud" projekt HLK05-12
HLK05-12 "Laboratoorsete eukarüootsete mikroorganismide, loomsete rakukultuuride ning transgeensete embrüonaalsete tüvirakkude kollektsioon (1.01.2005−31.12.2008)", Juhan Sedman, Tartu Ülikool, Bioloogia-geograafiateaduskond, Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond.
HLK05-12
Laboratoorsete eukarüootsete mikroorganismide, loomsete rakukultuuride ning transgeensete embrüonaalsete tüvirakkude kollektsioon
1.01.2005
31.12.2008
Riiklik programm: Humanitaar- ja loodusteduslikud kogud
AsutusRollPeriood
Tartu Ülikool, Bioloogia-geograafiateaduskondkoordinaator01.01.2005−31.12.2007
Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskondkoordinaator01.01.2008−31.12.2008
PerioodSumma
01.01.2005−31.12.2005380 660,00 EEK (24 328,61 EUR)
01.01.2006−31.12.2006380 660,00 EEK (24 328,61 EUR)
01.01.2007−31.12.2007329 500,00 EEK (21 058,89 EUR)
01.01.2008−31.12.2008329 500,00 EEK (21 058,89 EUR)
90 775,00 EUR

PROJEKTI EESMÄRGID KOGUDE HOIUTINGIMUSTE JA SÄILIMISE PARANDAMISEL, KOGUDE KORRASTAMISEL JA VAJALIKU KAADRI (SEALHULGAS KVALIFITSEERITUD KURAATORID) KOOLITAMISEL. PROJEKTI TÄHTSUS PROGRAMMI PÕHIEESMÄRKIDE SAAVUTAMISEL (1 lk): TÜ Molekulaar- ja rakubioloogia instituudis (TÜMRI) on laiaulatuslik eukarüootsete mikroorganismide, loomsete rakukultuuride ja transgeensete embrüonaalsete tüvirakkude kollektsioon, mis sisaldab nii rahvusvahelistest kultuurkollektsioonidest pärit kui ka antud instituudis valmistatud rakutüvesid. Kollektsiooni säilitatakse tsentraalselt ning selle ressursid on avatud kõigile antud kultuuridega töötama volitatud isikutele TÜMRI raames. Säilitatavate kultuuride nimekirjast on luuakse pidevalt uuendatav arvutiandmebaas, mis sisaldab kõikide olemasolevate rakukultuuride kirjeldusi. Antud kultuure säilitatakse sügavkülmutatud ja/või lüofiliseeritud kujul. Tüvede kollektsiooni eesmärgiks on instituudis toimuva teadus- ja õppetöö läbiviimine ning olemasolevate rakukultuuride näidiste, samuti olemasolevate mikroorganismide tüvede distributeerimine nõudmise korral kolleegidele üle kogu maailma asuvatesse teistesse teadusasutustesse. Käesoleva projekti eesmärgiks on 1. Tagada olemasoleva kollektsiooni säilitamiseks vajaliku vedela lämmastiku ostmine. 2. Säilitamistingimuste uuendamine, lisades kogude hoidmiseks vajaliku keskkonnasõbraliku freooni baasil töötava sügavlülmiku. 3. Olemasoleva andmebaasi uuendamine. Vastavate eesmärkide saavutamiseks ja olemasolevate kollektsioonide korrastamiseks soovime tööle võtta põhikohaga vanemlaborandi ja labori juhataja, esialgselt planeerituna vastavalt Sulev Kuuse ja Anne Kallingu.

Vastutav täitja (1)

IsikKraadTöökoht ja ametCVOsalemise periood
Juhan SedmandoktorikraadTartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Molekulaar- ja Rakubioloogia Instituut; Professor (1.00); Tartu Ülikool, Bioloogia-geograafiateaduskond; Professor (1.00);EST / ENG01.01.2008−31.12.2008

Põhitäitjad (3)

IsikKraadTöökoht ja ametCVOsalemise periood
Joachim Matthias GerholddoktorikraadTartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Molekulaar- ja Rakubioloogia Instituut, Üldise ja mikroobibiokeemia õppetool; laborant (0.50); Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Molekulaar- ja Rakubioloogia Instituut, Üldise ja mikroobibiokeemia õppetool; laborant (1.00); Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Molekulaar- ja Rakubioloogia Instituut, Üldise ja mikroobibiokeemia õppetool; laborant (0.50); Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Molekulaar- ja Rakubioloogia Instituut, Üldise ja mikroobibiokeemia õppetool; laborant; Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Molekulaar- ja Rakubioloogia Instituut, Üldise ja mikroobibiokeemia õppetool; doktorant (1.00);EST / ENG01.01.2008−31.12.2008
Anne KallingEST / ENG01.01.2005−31.12.2008
Sulev KuusemagistrikraadEST / ENG01.01.2005−31.12.2008

Projektiga seotud tööjõud (1)

IsikKraadAsutusAmetKoormusKoormus väljaspoolOsalemise periood
ProjektisKoormus väljaspool
Joachim Gerholddoktorant0,501.01.2005−31.12.2007
Publikatsioonid
Publikatsioonid
Kiiver, K.; Merits, A.; Ustav, M.; Žusinaite, E. (2006). Complex formation between hepatitis C virus NS2 and NS3 proteins. Virus Research, 117 (2), 264−272.
Lulla, V.; Merits, A.; Sarin, P.; Kääriäinen, L.; Keränen, S.; Ahola, T (2006). Identification of Mutations Causing Temperature-Sensitive Defects in Semliki Forest Virus RNA Synthesis. Journal of Virology, 80 (6), 3108−3111.
Lulla, A.; Lulla, V.; Tints, K.; Ahola, T.; Merits, A. (2006). Molecular Determinants of Substrate Specificity for Semliki Forest Virus Nonstructural Protease. Journal of Virology, 80 (11), 5413−5422.
Välk, Kristjan; Vooder, Tõnu; Petzold, Cathleen; Metspalu, Andres (2006). Data of NSCLC gene expression pilot study. European Journal of Human Genetics: European Human Genetics Conference 2005, Amsterdam, Netherland, May 6-9, 2006. Nature Publishing Group, 220.
Hallast, P.; Rull, K.; Laan, M. (2007). The evolution and genomic landscape of CGB1 and CGB2 genes. Molecular and Cellular Endocrinology, 260-262, 2−11.
Kilk, A.; Rausalu, K.; Ustav, M. (2006). Bovine papillornavirus type 1 oncoprotein E5 stimulates the utilization of superoxide radicals in the mouse fibroblast cell line C127. Chemico-Biological Interactions, 159 (3), 205−212.
Ilves, I.; Mäemets, K.; Silla, T.; Janikson, K.; Ustav, M. (2006). Brd4 is involved in multiple processes of bovine papillomavirus BPV1 life cycle. Journal of Virology, 80 (7), 3660−3665.
Kurg, R; Tekkel, Helena; Abroi, Aare; Ustav, Mart (2006). Characterizarion of the functional activities of the bovine papillomavirus type 1 E2 protein single-chain heterodimers. Journal of Virology, 80 (22), 11218−11225.
Hallast, P.; Rull, K.; Laan, M. (2007). The evolution and genomic landscape of CGB1 and CGB2 genes. Molecular and Cellular Endocrinology, 260-262, 2−11.
Juhendamised
Juhendamised
Silja Kuusk, doktorikraad, 2006, (juh) Juhan Sedman, Biochemical properties of Hmi1p, a DNA helicase from Saccharomyces cerevisiae mitochondria, Tartu Ülikool, Bioloogia-geograafiateaduskond, Molekulaar- ja rakubioloogia instituut.
Elin Org, doktorikraad, 2006, (juh) Andres Metspalu, The comparative patterns of linkage disequilibrium in European populations and its implication for genetic association studies, University of Tartu.
Kollektsioonid ja kogud
Kollektsioonid ja kogud
Loomsete rakukultuuride ja eukarüootsete mikroorganismide kollektsioon, Tartu Ülikool.