"Sihtfinantseerimine" projekt SF0180026s08
SF0180026s08 "Balti mere õliga reostatud vee mikroobikoosluste kataboolne potentsiaal ja selle ökosüsteemi bakterite biodegradatiivsete plasmiidide genoomi organisatsioon ja evolutsioon (1.01.2008−31.12.2013)", Ain Heinaru, Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Molekulaar- ja Rakubioloogia Instituut.
SF0180026s08
Balti mere õliga reostatud vee mikroobikoosluste kataboolne potentsiaal ja selle ökosüsteemi bakterite biodegradatiivsete plasmiidide genoomi organisatsioon ja evolutsioon
Catabolic performance of microbial communities in oil-contaminated Baltic Sea water and biodegradative plasmid genome organisation and evolution in bacteria of this ecosystem
1.01.2008
31.12.2013
Teadus- ja arendusprojekt
Sihtfinantseerimine
ValdkondAlamvaldkondCERCS erialaFrascati Manual’i erialaProtsent
1. Bio- ja keskkonnateadused1.2. MikrobioloogiaB230 Mikrobioloogia, bakterioloogia, viroloogia, mükoloogia 1.5. Bioteadused (bioloogia, botaanika, bakterioloogia, mikrobioloogia, zooloogia, entomoloogia, geneetika, biokeemia, biofüüsika jt100,0
PerioodSumma
01.01.2008−31.12.20081 890 000,00 EEK (120 793,02 EUR)
01.01.2009−31.12.20091 734 336,00 EEK (110 844,27 EUR)
01.01.2010−31.12.20101 636 200,00 EEK (104 572,24 EUR)
01.01.2011−31.12.2011104 570,00 EUR
01.01.2012−31.12.201294 430,00 EUR
01.01.2013−31.12.201394 430,00 EUR
629 639,53 EUR

Käesolev teadusprojekt seostub Balti mere mikroobide biodegradatiivse potsentsiaali uurimisega, eriti õlireostuse korral. Töö koosneb kahest põhilisest osast. Esimese osa uuringud on seotud merega Eesti territooriumi lähedal. Planeeritakse määratleda mikroobide biodegradatiivne potsentsiaal DNA profiilide sedastamise ja biodegradatiivsete bakterite isoleerimisega. Töö käigus isoleeritavatel ja geneetiliselt iseloomustatavatel bakteritüvedel on lisaks teaduslikule ka majanduslik väärtus merevee õlireostuse kõrvaldamisel. Teine töö osa uurib biodegradatiivsete plasmiidide päritolu ja evolutsiooni, eelkõige geenide horisontaalse ülekande, geenide korduvuste ja genoomsete saarte määratlemisega. Määratakse täielik nukleotiidne järjestus mitmel biodegradatiivsel plasmiidil. Me planeerime publitseerida saadud teadustulemused ca 20 rahvusvahelises CC-tasemega ajakirjas ja konverentsi materjalides, kaitsta teemaga seotult vähemalt 6 PhD tööd, koostada ja esitada vähemalt 1 patenditaotlus.
Current research project is connected with the study of biodegradation potential of microbes in the Baltic Sea, especially in case of oil spills. It consists of two main parts. The first one is connected directly with the sea, near the Estonian territory. We expect to determine the biodegradative potential by DNA profiling and isolation of biodegrdative bacterial strains. We belive that the isolated and genetically characterized bacterial strains could have both scientific and commercial value for cleaning up oil contaminated marine environment. The second part of the project is connected with study of evolution and origin of biodegradative plasmids in context of horizontal gene transfer, gene redundancy and genomic islands. The complete nucleotide sequence of several biodegradative plasmids would be determined. We intend to publish our results in ca 20 international CC-level journals and conference materials, to complete 6 PhD works and to perform at least one patent application.