"Eesti Teadusfondi uurimistoetus" projekt ETF5554
ETF5554 (ETF5554) "Hemostaasi, angiogeneesi ja apoptoosi mõjutavad valgud viperiidsete madude mürkidest. (1.01.2003−31.12.2006)", Jüri Siigur, Keemilise ja Bioloogilise Füüsika Instituut.
ETF5554
Hemostaasi, angiogeneesi ja apoptoosi mõjutavad valgud viperiidsete madude mürkidest.
Proteins affecting haemostasis, angiogenesis and apoptosis from viper snake venoms.
1.01.2003
31.12.2006
Teadus- ja arendusprojekt
Eesti Teadusfondi uurimistoetus
ETIS klassifikaatorAlamvaldkondCERCS klassifikaatorFrascati Manual’i klassifikaatorProtsent
4. Loodusteadused ja tehnika4.11. Keemia ja keemiatehnikaT411 Radiofarmaatsiatehnoloogia 2.3. Teised tehnika- ja inseneriteadused (keemiatehnika, lennundustehnika, mehaanika, metallurgia, materjaliteadus ning teised seotud erialad: puidutehnoloogia, geodeesia, tööstuskeemia, toiduainete tehnoloogia, süsteemianalüüs, metallurgia, mäendus, tekstiilitehnoloogia ja teised seotud teadused).100,0
AsutusRollPeriood
Keemilise ja Bioloogilise Füüsika Instituutkoordinaator01.01.2003−31.12.2006
PerioodSumma
01.01.2003−31.12.2003115 000,00 EEK (7 349,84 EUR)
01.01.2004−31.12.2004115 000,00 EEK (7 349,84 EUR)
01.01.2005−31.12.2005115 000,00 EEK (7 349,84 EUR)
01.01.2006−31.12.2006117 240,00 EEK (7 493,00 EUR)
29 542,52 EUR

Käesoleva projekti eesmärgiks on uute unikaalsete hemostaasi, angiogeneesi ja apoptoosi mõjutavate valkude molekulaarsete ja funktsionaalsete omaduste uurimine. Valgud eraldatakse viperiidsete madude mürkidest, kombineerides erinevaid meetodeid- geelfiltratsiooni, ioonvahetust, isoelektrilist fokuseerimist, kõrgsurve vedelikkromatograafiat, afiinsuskromatograafiat. Eraldatud valkude rakulise toime uurimisel kasutatakse trombotsüüte, HUVEC, K-562 ja teisi rakke. Määratakse gürsa mürgist eraldatud unikaalsete valkude (näiteks disintegriinid, disintegriinisarnased valgud, apoptoosi indutseerivad metalloproteinaasid) primaarne struktuur neid kodeeriva DNA kaudu, selleks kasutame meie poolt sünteesitud gürsa mürginäärme cDNA panka.Saadud primaarstruktuuride ja kirjanduses leiduvate andmete analüüs võimaldab selgitada nende oluliste valkude struktuuri ja funktsiooni vahelisi seoseid, sealhulgas ka seostumist eri tüüpi rakkude pinnal olevate retseptoritega. Reeglina disintegriinid ei ole glükosüleeritud, see loob eelduse rekombinantsete valkude saamiseks bakteriaalsetes ekspressiooni süsteemides. Rekombinantsete valkude omadusi võrreldakse natiivsete valkudega. Saadud tulemused on olulised valk-valk interaktsioonide fundamentaaluuringutel, mõned valgud kui angiogeneesi inhibiitorid ja ka kui trombotsüütide agregatsiooni pidurdajad võivad osutuda potentsiaalseteks ravimiteks vähi ja ka trombooside korral. Uuritud ainete struktuuride alusel on võimalik disainida efektiivsemaid potentsiaalseid ravimeid.
The project is aimed at the study of molecular and functional properties of unique proteins affecting haemostasis, angiogenesis, apoptosis. The proteins will be separated from viper venoms (Levantine viper, Common viper) combining protein purification methods such as gel filtration, ion-exchange chromatography, HPLC, affinity chromatograpy, electrophoresis and isoelectric focusing. The protein interactions with cells will be detected using platelets, human umbilical vein endothelial cells (HUVEC), K-562 and some other tumor cells. The primary structure of the proteins separated from Levantine viper (disintegrin/disintegrin-like proteins, apoptosis inducing metalloproteinases) will be deduced from the DNA encoding the protein using our Levantine viper venom gland cDNA library.The analysis of obtained protein structures and literature provided data allows to elucidate structure-function relationships and also the peculiarities of the binding of these proteins to different cell surface receptors. We plan to obtain disintegrin/disintegrin-like (usually nonglycosylated) recombinant proteins using bacterial expression systems. The molecular and functional properties of recombinant proteins will be compared with native ones.The results of the project will be essential for protein-protein interaction fundamental studies. Inhibitors of angiogenesis and platelet aggregation may be potential antitumor and antithrombotic drugs.The structural studies are useful for designing more effective potential drugs.