RNA-viirused on ürgne grupp patogeene, mille ülisuur ja pidevalt kasvav meditsiiniline tähtsus tuleneb RNA replikatsiooni fundamentaalsetest omadustest. Seda protsessi läbiviiv RNA replikaas on kodeeritud viiruse poolt; sellesse kompleksi kuuluvad viiruse valgud on seotud ka viiruse põhjustatud patoloogiliste efektidega. Kavas on alfaviiruset näitel uurida viiruse replikatsioonisüsteemi moodustamist, selle komponentide ning süsteemi kui terviku funktsioone, sh. interaktsioone peremeesraku valkude ja struktuuridega. Uurimiseks on kavas kasutada nii rekombinantseid viiruseid kui ka replikaasi rekonstrueerimist rakus. Rekombinantseid viiruseid kasutatakse ka viirusliku patogeneesi ja viirus-peremeesorganism interaktsioonide uurimiseks. Töö tulemusena saadavad andmed võimaldavad paremini mõista infektsiooni aluseid, luua katse-süsteeme viirus-vastaste ühendite analüüsimiseks ning leida uusi ja efektiivseid võimalusi viiruslike süsteemide kasutamiseks geenitehnoloogias ja – vaktsineerimises
RNA-viruses are an ancient group of pathogens; their enormous and constantly increasing medical importance results from fundamental properties of their RNA-replication. The RNA replicases are virus-encoded complexes; their components are also involved in virus-induced cytotoxicity. Our aims are: i) to analyze the pathway(s) of the formation of replicase complexes of alphaviruses; ii) to study the functions of that complex and its separate components, iii) to analyze their interactions with host components. Recombinant viruses and reconstructed replicase complexes will be used as tools for these studies. We will also use recombinant viruses for studies of virus-induce pathogenesis in vivo. The results of this research program will be important for understanding of the basic mechanisms involved in RNA-virus infection; they will also be used for development of screening systems for anti-viral drugs and for development of new virus-based systems for gene technology and gene vaccination