"Muu" projekt HHMI 55000316
HHMI 55000316 "Bakterite füsioloogilisest seisundist mõjutatud geneetiliste ümberkorralduste regulatsiooni uuringud perekond Pseudomonas bakteritel (1.01.2001−31.12.2005)", Maia Kivisaar, Eesti Biokeskus.
HHMI 55000316
HHMI 55000316
Bakterite füsioloogilisest seisundist mõjutatud geneetiliste ümberkorralduste regulatsiooni uuringud perekond Pseudomonas bakteritel
Study of regulation of genetic rearrangements in pseudomonads as a function of physiological state of bacteria
Study of regulation of genetic rearrangements in pseudomonads as a function of physiological state of bacteria
1.01.2001
31.12.2005
Teadus- ja arendusprojekt
Muu
ETIS klassifikaatorAlamvaldkondCERCS klassifikaatorFrascati Manual’i klassifikaatorProtsent
1. Bio- ja keskkonnateadused1.3. GeneetikaB220 Geneetika, tsütogeneetika 1.5. Bioteadused (bioloogia, botaanika, bakterioloogia, mikrobioloogia, zooloogia, entomoloogia, geneetika, biokeemia, biofüüsika jt100,0
AsutusRollPeriood
Eesti Biokeskuskoordinaator01.01.2001−31.12.2005
AsutusRiikTüüp
Howard Hughes Medical Institute, USA
PerioodSumma
01.01.2001−31.12.20052 875 000,00 EEK (183 745,99 EUR)
183 745,99 EUR
International Research Scholars Program International Research Scholars Program (Baltics, Central and Eastern Europe, and Former Soviet Union)

Stressis olevates bakterirakkudes on kirjeldatud mobiilsete DNA elementide transponeerumise ja teiste geneetiliste muutuste intensiivistumist. Meie uurime statsionaarse faasi mutatsioonide tekkemehhanisme nälgivates bakterites. Uurime vea-altide DNA polümeraaside osalust ja DNA reparatsioonisüsteemide võimalikku alatalitlust statsionaarse faasi mutatsioonide tekkel. Samuti uurime mehhanisme, mis kontrollivad mobiilsete DNA elementide transponeerumissagedust stressitingimustes. Saadud tulemused aitavad täpsemalt mõista molekulaarseid mehhanisme, mis viivad mikroobipopulatsiooni kiirele evolutsioneerumisele muutuvates keskkonnatingimustes. Saadud informatsiooni abil on võimalik välja töötada ka uusi meetodeid võitlemaks keskkonnaga kiiresti adapteeruvate patogeensete bakteritega.
The goal of this project is to understand mechanisms that control genetic rearrangements in bacteria exposed to environmental stress. In this project we will use Pseudomonas putida as a model organism to study molecular mechanisms of mutational processes and regulation of transposition as a function of physiological state of bacteria. The experiments will entail both molecular analyses and in vivo functional assays. We will (i) investigate mechanisms of regulation of transposition of Tn3 family transposon Tn4652 in P. putida and in other pseudomonads; (ii) construct and characterise DNA mismatch and GO repair-deficient P. putida strains and study the regulation of expression of DNA repair pathways in P. putida and in other Pseudomonas species. Our studies will aid in elucidating the fundamental mechanisms by which genetic rearrangements can occur in bacteria living in their natural environment.
KirjeldusProtsent
Alusuuring100,0