See veebileht kasutab küpsiseid kasutaja sessiooni andmete hoidmiseks. Veebilehe kasutamisega nõustute ETISe kasutustingimustega. Loe rohkem
Olen nõus
"Eesti Teadusfondi uurimistoetus (ETF)" projekt ETF7479
ETF7479 "Wfs1 valgu (volframiini) funktsioon – molekulaarne ja süsteemibioloogiline lähenemine (1.01.2008−31.12.2011)", Sulev Kõks, Tartu Ülikool, Arstiteaduskond.
ETF7479
Wfs1 valgu (volframiini) funktsioon – molekulaarne ja süsteemibioloogiline lähenemine
The function of wfs1 protein - molecular and systems biology approach
1.01.2008
31.12.2011
Teadus- ja arendusprojekt
Eesti Teadusfondi uurimistoetus (ETF)
ETIS klassifikaatorAlamvaldkondCERCS klassifikaatorFrascati Manual’i klassifikaatorProtsent
3. Terviseuuringud3.1. BiomeditsiinB470 Füsioloogia 3.1. Biomeditsiin (anatoomia, tsütoloogia, füsioloogia, geneetika, farmaatsia, farmakoloogia, kliiniline keemia, kliiniline mikrobioloogia, patoloogia)50,0
3. Terviseuuringud3.1. BiomeditsiinB480 Endokrinoloogia, sekretsioonisüsteemid, diabetoloogia 3.1. Biomeditsiin (anatoomia, tsütoloogia, füsioloogia, geneetika, farmaatsia, farmakoloogia, kliiniline keemia, kliiniline mikrobioloogia, patoloogia)50,0
AsutusRollPeriood
Tartu Ülikool, Arstiteaduskondkoordinaator01.01.2008−31.12.2011
PerioodSumma
01.01.2008−31.12.2008597 600,00 EEK (38 193,60 EUR)
01.01.2009−31.12.2009573 696,00 EEK (36 665,86 EUR)
01.01.2010−31.12.2010573 696,00 EEK (36 665,86 EUR)
01.01.2011−31.12.201136 666,00 EUR
148 191,32 EUR

Projekti eesmärgiks on selgitada wfs1 geeni produkti, wfs1 valgu (volframiini) molekulaarset funktsiooni. Wfs1 valgu defektid kutsuvad inimestel esile väga rasket kaasasündinud sündroomi - Wolframi sündroomi, samuti on wfs1 geenis asuvad geneetilised polümorrfismid seotud erinevate haiguste suurenenud riskiga (diabeet, depressioon, bipolaarne häire, kurtus jne). Füsioloogia instituudis on wfs1 valku uuritud juba mõned aastad ning selle aja jooksul oleme näidanud wfs1 rolli depressiooniriski kujunemisel inimestel ning emotsionaalse käitumimse regulatsioonis hiirtel (oleme loonud vastava mutanthiire). Wfs1 valk on oma ulatusliku rolli tõttu olulise teadusliku tähelepanu all, kuid sellel vaatamata ei ole tema molekulaarne funktsioon veel selge. On püstitatud mitmeid erinevaid hüpoteese - wfs1 omab ise ensümaatilist aktiivsust (prenüültransferaas, PPT või inositool monofosfaadi dehüdrogenaas, IMPDH), ta reguleerib mõningaid proteolüütilisi ensüüme (prohormooni konvertaasid, PCd; karboksüpeptidaas E/D, CPE/D; vms), wfs1 on Ca2+ kanal ERi membraanis ning vastutab ERi Ca2+ tasakaalu eest; wfs1 on seotud ERi stressiga. Selge on vaid niipalju, et wfs1 funktsiooni häirumine viib ulatuslikele degeneratiivsetele muutustele nii inimesel kui ka hiirel. Meie projekti eesmärgiks on detailne wfs1 funktsiooni analüüs, kasutades süsteemibioloogilist ja molekulaarset lähenemist kombineerituna. Eesmärkideks on - uue, stabiilsema mudelsüsteemi loomine (uus hiiremudel); leida wfs1 mutatsiooni tagajärjel tekkivad muutused hiire transkriptoomis (terviklik, 180 000 transkripti haarav analüüs, SAGE meetodil), selle funktsionaalne annotatsioon ja süsteemne analüüs; kontrollida erinevate proteolüütiliste ensüümide aktiivsust (PCd, CPE/D); kontrollida IMPDH ja PPT aktiivsust; kirjeldada detailselt wfs1 valgu funktsioon ERi stressis; otsida võimalikke uusi interaktsioonipartnereid ning lõpuks kogu informatsiooni summaarne analüüs. Projekt viiakse ellu suuresti TÜ füsioloogia instituudis kus on olemas vajalik aparatuur ja oskusteave, koostööd tehakse biokeemia instituudiga ning tehnoloogiainstituudiga.
Aim the project is to define the molecular function of wfs1 protein. Mutations in the wfs1 protein cause in humans very severe disease – Wolfram syndrome. Polymorphisms in the wfs1 gene are associated with increased genetic risk for several multifactorial diseases (diabetes, deafness, mood disorders). At the Department of Physiology we have studied the wfs1 gene during last few years and we have established increased risk for mood disorders related to the SNPs in the wfs1 gene and its role in the regulation of emotional behavior of mice (we have generated mouse model lacking wfs1 gene). Despite the intensive research the function of wfs1 protein is still unknown. Different alternative hypotheses for the function of wfs1 have been proposed – wfs1 regulates ER stress or wfs1 may have enzymatic activity (prenyltransferase, PPT; or inositol monophosphate dehydrogenase, IMPDH) or wfs1 regulates the activity of some other enzyme (prohormone convertases, PCs; or carboxypeptidase E/D, CPE/D) or wfs1 is Ca2+ channel in the ER membrane and is responsible for the equilibrium in the ER. The only thing what is clear, is that deficiency in the function of wfs1 causes widespread degenerative alterations in humans and in mice. Aim of our project is to analyze the function of wfs1 gene in detail by combining systems biology and molecular biology approaches. The goal is to develop a new mutant mouce, describe the changes in the mouse transcriptome (SAGE analysis to describe whole transcriptome 180 000 transcripts) after the deletion of wfs1, functional annotation and systemic analysis of induced changes, to control the proteolytic activities of different enzymes, to control possible IMPDH and PPT activity, to describe in detail the involvement of wfs1 protein in ER stress; to find novel potential interaction partners and finally to perform systemic analysis of all the gathered information. Project will be carried out at the Department of Physiology where necessary equipment and know-how exists, for more complicated parts we plan collaboration with the Technology Institute of the University of Tartu and the Department of Biochemistry.