See veebileht kasutab küpsiseid kasutaja sessiooni andmete hoidmiseks. Veebilehe kasutamisega nõustute ETISe kasutustingimustega. Loe rohkem
Olen nõus
"Eesti Teadusfondi uurimistoetus" projekt ETF6841
ETF6841 (ETF6841) "Oligonukleotiidide kiibil põhineva transkriptsioonifaktorite määramise meetodi väljatöötlus, transkriptsioonifaktorite profileerimine basaalrakulistes kartsinoomides (1.01.2006−31.12.2009)", Andres Valkna, Tallinna Tehnikaülikool, Matemaatika-loodusteaduskond.
ETF6841
Oligonukleotiidide kiibil põhineva transkriptsioonifaktorite määramise meetodi väljatöötlus, transkriptsioonifaktorite profileerimine basaalrakulistes kartsinoomides
Development of novel microarray based method, identification of profiles of transcription factors in basal cell carcinomas (BCC-s)
1.01.2006
31.12.2009
Teadus- ja arendusprojekt
Eesti Teadusfondi uurimistoetus
ETIS klassifikaatorAlamvaldkondCERCS klassifikaatorFrascati Manual’i klassifikaatorProtsent
4. Loodusteadused ja tehnika4.16. Biotehnoloogia (loodusteadused ja tehnika)601 2.3. Teised tehnika- ja inseneriteadused (keemiatehnika, lennundustehnika, mehaanika, metallurgia, materjaliteadus ning teised seotud erialad: puidutehnoloogia, geodeesia, tööstuskeemia, toiduainete tehnoloogia, süsteemianalüüs, metallurgia, mäendus, tekstiilitehnoloogia ja teised seotud teadused).34,0
1. Bio- ja keskkonnateadused1.12. Bio- ja keskkonnateadustega seotud uuringud, näiteks biotehnoloogia, molekulaarbioloogia, rakubioloogia, biofüüsika, majandus- ja tehnoloogiauuringud601 1.3. Keemiateadused (keemia ja muud seotud teadused)33,0
3. Terviseuuringud3.1. Biomeditsiin601 3.1. Biomeditsiin (anatoomia, tsütoloogia, füsioloogia, geneetika, farmaatsia, farmakoloogia, kliiniline keemia, kliiniline mikrobioloogia, patoloogia)33,0
PerioodSumma
01.01.2007−31.12.2007123 000,00 EEK (7 861,13 EUR)
01.01.2006−31.12.2006120 000,00 EEK (7 669,40 EUR)
01.01.2008−31.12.200899 000,00 EEK (6 327,25 EUR)
01.01.2009−31.12.200995 040,00 EEK (6 074,16 EUR)
27 931,94 EUR

Transkriptsioonifaktorite profileerimine loob võimaluse nende üle- või alaekspressiooni kaudu kaudselt leida geenid, mille ekspressioon on häiritud ja mis seetõttu võivad olla seotud basaalrakulise kartsinoomi tekkega. Käesoleva projekti eesmärgiks on arendada välja metodoloogia määramaks transkriptsioonifaktorite profiile võrdlevalt normaalsete rakkudega (karvanääpsu keratinotsüüdid basaalrakulise kartsinoomi korral). Oleme välja töötanud sellise meetodi põhimõtte. See põhineb kaksikahelaliste oligonukleotiididel, mis on seotud kandjale. Need oligonukleotiidid sisaldavad transkriptsioonifaktorite konsensusjärjestusi, selle abil isoleeritakse spetsiifilised antud proteoomis esinevad transkriptsioonifaktorid. Transkriptsioonifaktorite profiilid määratakse fluorestsentssignaali alusel, vajadusel toimud nende identifitseerimine kasutades MALDI-TOF mass-spektroskoopiat.
Identification of differences in transcription factor profiles between normal and BCC cells would indirectly point out the genes that are abnormally expressed and could be important in BCC development. In the current project we undertake to develop a method that would allow profiling different transcription factors in diseased and normal cells/tissues. The information obtained could elucidate details of complex mechanisms behind skin cancer. We have developed a principle of such method. It is based on the ability of double-stranded oligonucleotides corresponding to consensus sequences of transcription factors to bind specific protein in vitro. Intracellular proteins (transcription factors) that bind these oligonucleotide sequences could be “pulled” out from the cell lysate using previously described interaction. According to our approach the cell lysate will be globally labelled and proteins interacting with consensus sequences will be captured. The identification of these proteins will be performed using mass-spectroscopic methods.