"Sihtfinantseerimine" projekt SF0182566Bs03
SF0182566Bs03 "RNA ja DNA genoomiga viiruste replikatsioonimehhanismide uurimine ja geeniteraapia ning geenvaktsineerimise uute meetodite väljatöötamine B (1.01.2003−31.12.2007)", Mart Ustav, Tartu Ülikool, Bioloogia-geograafiateaduskond.
SF0182566Bs03
RNA ja DNA genoomiga viiruste replikatsioonimehhanismide uurimine ja geeniteraapia ning geenvaktsineerimise uute meetodite väljatöötamine B
Study of the replication mechanisms of RNA and DNA viruses and development of new methods for gene therapy and gene vaccination B
1.01.2003
31.12.2007
Teadus- ja arendusprojekt
Sihtfinantseerimine
ETIS klassifikaatorAlamvaldkondCERCS klassifikaatorFrascati Manual’i klassifikaatorProtsent
1. Bio- ja keskkonnateadused1.12. Bio- ja keskkonnateadustega seotud uuringud, näiteks biotehnoloogia, molekulaarbioloogia, rakubioloogia, biofüüsika, majandus- ja tehnoloogiauuringudB220 Geneetika, tsütogeneetika 1.5. Bioteadused (bioloogia, botaanika, bakterioloogia, mikrobioloogia, zooloogia, entomoloogia, geneetika, biokeemia, biofüüsika jt50,0
3. Terviseuuringud3.11. Terviseuuringutega seotud uuringud, näiteks biokeemia, geneetika, mikrobioloogia, biotehnoloogia, molekulaarbioloogia, rakubioloogia, biofüüsika ja bioinformaatikaB200 Tsütoloogia, onkoloogia, kantseroloogia3.1. Biomeditsiin (anatoomia, tsütoloogia, füsioloogia, geneetika, farmaatsia, farmakoloogia, kliiniline keemia, kliiniline mikrobioloogia, patoloogia)50,0
AsutusRollPeriood
Tartu Ülikool, Bioloogia-geograafiateaduskondkoordinaator01.01.2003−31.12.2007
PerioodSumma
01.01.2003−31.12.2003745 000,00 EEK (47 614,18 EUR)
01.01.2004−31.12.20041 025 000,00 EEK (65 509,44 EUR)
01.01.2005−31.12.20051 025 000,00 EEK (65 509,44 EUR)
01.01.2006−31.12.20061 025 000,00 EEK (65 509,44 EUR)
01.01.2007−31.12.20071 025 000,00 EEK (65 509,44 EUR)
309 651,94 EUR

Teadusteema koosneb kahest alamteemast ja jaotub kolme asutuse (TÜ MRI, EBK ja TÜ TI) vahel. Teemat täidavad 11 täiskohaga teadustöötajat, teema ja A alateema juhendajaks on professor Mart Ustav ja B alamteema juhiks on vanemteadur  Andres Merits.  Uuritakse: 1) Papilloomiviiruste replikatsiooni mehhanisme algses amplifikatsioonilises ja järgnevates latentses ja terminaalselt diferentseerunud keratinotsüütides asetleidvas vegetatiivses faasis. Eriline tähelepanu pööratakse alusuuringutele, mille abil selgitatakse välja mehhanism, mille alusel toimub viiruse genoomi episoomide jaotumine jagunevates rakkudes ja mehhanismid, mis kindlustavad viiruse genoomi replikatsiooni vegetatiivses faasis. 2) Alamteema B raames on uurimisobjektideks hepatiit C viirus ja alfaviiruste perekonda kuuluv Semliki Forest viirus. Töö käigus püütakse välja selgitada a) alfaviiruste (SFV) replikatsiooniaparaadi struktuur, selle moodustumise mehhanismid; b) SFV viirusvalkude omavahelised interaktsioonid; b) SFV elutsükli regulatsioonimehhanismid; d) SFV-peremees interaktsioonid; e) rekonstrueerida HCV genoomi replikatsioonisüsteem in vitro ja uurida replikatsioonil osalevaid replikatsioonikomplekse. Mõlema alamteema täitmisel kasutatakse kaasaegseid molekulaarbioloogia ja viroloogia meetodeid. Teema täitmisel osaleb rida doktorante ja magistrande.  Kavandatav teadustöö seab eesmärgiks alusuuringud, kuid need viiakse läbi eesmärgiga kasutada saadud teavet uut tüüpi geeniteraapia ja geenvaktsineerimise meetodite väljatöötamiseks. Eriline tähelepanu pööratakse uut tüüpi ekspressioonivektorite loomisele, mis võimaldaksid nende kasutamise näiteks, nii immuunsüsteemi lühiajalisel aktiveerimisel kui ka juhtudel kui on vajalik geenide pikaajaline stabiilne ekspressioon.
The research program is comprised of two parts and will be carried out in the premises of three research organisations: a) Institute of Molecular and Cell Biology, Univ. of Tartu, Estonian Biocentre and Institute of Technology, Univ. of Tartu. The PI of the program and Head of the A subprogram is prof. Mart Ustav, while subprogram B is led by Dr. Andres Merits. We plan to study: 1) the replication mechanisms of papillomaviruses during the initial amplification, latent replication and vegetative replication phases. Specific effort will be made for the basic studies of the mechanisms assuring proper segregation and partitioning of the viral episomes in the dividing cells and mechanisms driving the vegetative replication. 2) Sup-program B will concentrate on the Hepatitis C virus and Semliki Forest virus. The specific aims of the project are: a) analysis of the structure and formation of the replication complexes; b) study of interactions between viral proteins; c) mechanisms of regulation of life cycle; d) virus-host interactions; e) to reconstitute the in vitro replication system and to study the replication complexes participating in the HCV replication. We shall use the modern methods of  Molecular Biology and Virology in our work. In the process of research many graduate students of M.Sci and Ph.D level will participate. Although major attention will be on the basic research, we specifically work for use of the results of research for development of new methods for gene therapy and gene vaccination. Specific attention will be paid for the development of new type of expression vectors, which could be used for induction of specific immune response through transient expression of antigen of interest as well for long term stable expression of therapeutic genes in the gene therapy programs.