"Aparatuuri toetus" projekt SF0140108s08AP
SF0140108s08AP "Väikesemahulise teaduse infrastruktuuri kaasajastamine teadusteema SF0140108s08 raames (1.01.2010−31.12.2011)", Merike Kelve, Tallinna Tehnikaülikool, Matemaatika-loodusteaduskond.
SF0140108s08AP
Väikesemahulise teaduse infrastruktuuri kaasajastamine teadusteema SF0140108s08 raames
1.01.2010
31.12.2011
Infrastruktuuriprojekt
Aparatuuri toetus
ETIS klassifikaatorAlamvaldkondCERCS klassifikaatorFrascati Manual’i klassifikaatorProtsent
1. Bio- ja keskkonnateadused1.4. Ökoloogia, biosüstemaatika ja -füsioloogiaB260 Hüdrobioloogia, mere-bioloogia, veeökoloogia, limnoloogia 1.5. Bioteadused (bioloogia, botaanika, bakterioloogia, mikrobioloogia, zooloogia, entomoloogia, geneetika, biokeemia, biofüüsika jt10,0
1. Bio- ja keskkonnateadused1.1. BiokeemiaP310 Proteiinid, ensümoloogia1.5. Bioteadused (bioloogia, botaanika, bakterioloogia, mikrobioloogia, zooloogia, entomoloogia, geneetika, biokeemia, biofüüsika jt30,0
1. Bio- ja keskkonnateadused1.12. Bio- ja keskkonnateadustega seotud uuringud, näiteks biotehnoloogia, molekulaarbioloogia, rakubioloogia, biofüüsika, majandus- ja tehnoloogiauuringudP320 Nukleiinhappesüntees, proteiinisüntees 1.5. Bioteadused (bioloogia, botaanika, bakterioloogia, mikrobioloogia, zooloogia, entomoloogia, geneetika, biokeemia, biofüüsika jt60,0
PerioodSumma
01.01.2011−31.12.201136 429,64 EUR
36 429,64 EUR

Uurimuse peamine eesmärk on määrata adeniinnukleotiidie metaboolsete ensüümide põhilised biokeemilised tunnusjooned, iseloomustada nende geenide genoomset struktuuri, nende ekspressiooni ja selle regulatsiooni evolutsiooniliselt kõige madalamates hulkraksetes loomades – käsnades. Kahele põhilisele uuritavale ensüümile – 2-5A süntetaasile ja ATP N-glükosidaasile – lisanduvad 2-5A spetsiifiline ribonukleaas, 2-5A degradeeriv fosfodiesteraas, ADP ribosüültsüklaas, ATP ja selle derivaate modifitseerivad deaminaasid ja metülaasid. Otsitakse 2-5A süntetaasi ja ATP N-glükosidaasi võimalikke rolle organismi kaitsefunktsioonis, signaaliülekandes jne. Tulemused võimaldavad teha järeldusi adeniinnukleotiidide metaboolsete ensüümide evolutsiooni kohta, samuti nende rolli kohta kõrgemates loomades. Bioinformaatilisel võrdlemisel mere metagenoomiga selgitatakse väja käsnadega kooselavad mikroorganismid, kes võiksid oma vastavate ensümaatilise aktiivsuse kaudu mõjutada meie uurimistulemusi.
The goal of the research is to find out the basic biochemical features of a set of adenine nucleotide metabolic enzymes, to characterize the genomic structure and gene expression/regulation of these genes in the most ancient metazoa, sponges. The research will be focused on two enzymes – 2-5A synthetase and ATP N-glycosidase, but a number of others will be studied: 2-5A specific ribonuclease, 2-5A degrading phosphodiesterase, ADP-ribosyl cyclase, deaminases and methylases modifying ATP and its derivatives. The possible roles of the 2-5A synthetase and the ATP N-glycosidase in sponges in defence processes, cell signalling etc. will be studied. The results will allow us to draw conclusions about the evolution of the adenine nucleotide metabolic enzymes; we will also be able to inerpret their roles in mammals. A bioinformatic comparison with marine metagenome data will be used to pinpoint the micro-organisms, associated with sponges, possibly contributing to the effects under study.