"Sihtfinantseerimine" projekt SF0180032s12
SF0180032s12 (SF0180032s12) "Sensorsüsteemid signaaliülekandes osalevate biomolekulide vaheliste interaktsioonide mõõtmiseks (1.01.2012−31.12.2013)", Ago Rinken, Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Keemia Instituut.
SF0180032s12
Sensorsüsteemid signaaliülekandes osalevate biomolekulide vaheliste interaktsioonide mõõtmiseks
Sensor systems for characterization of biomolecule interactions in signal transduction
1.01.2012
31.12.2013
Teadus- ja arendusprojekt
Sihtfinantseerimine
ETIS klassifikaatorAlamvaldkondCERCS klassifikaatorFrascati Manual’i klassifikaatorProtsent
1. Bio- ja keskkonnateadused1.1. BiokeemiaP310 Proteiinid, ensümoloogia1.5. Bioteadused (bioloogia, botaanika, bakterioloogia, mikrobioloogia, zooloogia, entomoloogia, geneetika, biokeemia, biofüüsika jt50,0
4. Loodusteadused ja tehnika4.11. Keemia ja keemiatehnikaP370 Makromolekulaarkeemia 1.3. Keemiateadused (keemia ja muud seotud teadused)30,0
4. Loodusteadused ja tehnika4.16. Biotehnoloogia (loodusteadused ja tehnika)T360 Biokeemiatehnoloogia 2.3. Teised tehnika- ja inseneriteadused (keemiatehnika, lennundustehnika, mehaanika, metallurgia, materjaliteadus ning teised seotud erialad: puidutehnoloogia, geodeesia, tööstuskeemia, toiduainete tehnoloogia, süsteemianalüüs, metallurgia, mäendus, tekstiilitehnoloogia ja teised seotud teadused).20,0
PerioodSumma
01.01.2012−31.12.201276 630,00 EUR
01.01.2013−31.12.201376 630,00 EUR
153 260,00 EUR

Projekti eesmärgiks on arendada fluorestsentsil põhinevaid sensorsüsteeme, mida kasutatakse biomolekulide vaheliste interaktsioonide mõõtmiseks. Peamisteks märklaudadeks on G valguga seotud retseptorite signaaliülekanderaja komponendid. Retseptorite sidumisomaduste määramiseks arendatakse fluorestsentsi anisotroopial põhinevaid metoodikaid ja saadud tulemusi kasutatakse nii uute ravimkandidaatide disainil kui signaaliülekande füüsiko-keemiliste mudelite loomisel. G valkude aktivatsiooni jälgimiseks arendatakse fluorestsentsnukleotiidide sidumise metoodikat kui ka G valgu alaühikute vahelisel FRET-il põhinevat sensorit. Ülitundlikud sensorid, mis võimaldaksid jälgida protsesse üksikute molekulide tasemel, arendatakse evanestsentslainetel põhinevate meetodite põhjal. Selleks leitakse sobiva pinnaga kandjaid, et fluorofooride aktivatsioon TIRF süsteemis oleks määratav, võimendatakse fluorofoori signaali pinna plasmoonemissiooniga ja vähendatakse katseruumala mikrofluidika meetoditega.
The main objective of the project is to study and develop fluorescence-based sensor systems for characterization of interactions between biomolecules participating in signal transduction. The main targets are components of G protein coupled receptor systems. Fluorescence anisotropy-based method will be used for characterization of ligand binding to different receptors and obtained results will be used for the design of new drug precursors as well as for the development of physico-chemical models of signal transduction. The activation of G proteins will be detected by binding of fluorescently labeled nucleotide(s) or by measuring FRET between their subunits. Ultrasensitive sensors, monitoring processes on single molecule level, will be developed using evanescent wave-based methods. The tasks include finding an optimal coupling system for TIRF microscopy, while amplifying the signal with surface plasmon coupled emission and increasing concentrations using a microfluidic system.