See veebileht kasutab küpsiseid kasutaja sessiooni andmete hoidmiseks. Veebilehe kasutamisega nõustute ETISe kasutustingimustega. Loe rohkem
Olen nõus
"Eesti Teadusfondi uurimistoetus (ETF)" projekt ETF9478
ETF9478 "TrkB, Shh ja Notch signaaliradade funktsioon neuroblastoomides (1.01.2012−31.12.2015)", Marko Piirsoo, Tallinna Tehnikaülikool, Matemaatika-loodusteaduskond.
ETF9478
TrkB, Shh ja Notch signaaliradade funktsioon neuroblastoomides
Functions of TrkB, Shh and Notch signaling pathways in neuroblastomas.
1.01.2012
31.12.2015
Teadus- ja arendusprojekt
Eesti Teadusfondi uurimistoetus (ETF)
ETIS klassifikaatorAlamvaldkondCERCS klassifikaatorFrascati Manual’i klassifikaatorProtsent
1. Bio- ja keskkonnateadused1.12. Bio- ja keskkonnateadustega seotud uuringud, näiteks biotehnoloogia, molekulaarbioloogia, rakubioloogia, biofüüsika, majandus- ja tehnoloogiauuringudB200 Tsütoloogia, onkoloogia, kantseroloogia1.5. Bioteadused (bioloogia, botaanika, bakterioloogia, mikrobioloogia, zooloogia, entomoloogia, geneetika, biokeemia, biofüüsika jt100,0
PerioodSumma
01.01.2012−31.12.201217 400,00 EUR
01.01.2013−31.12.201317 400,00 EUR
01.01.2014−31.12.201417 400,00 EUR
01.01.2015−31.12.201517 400,00 EUR
69 600,00 EUR

Kasvaja metastaatilisele kasvule eelneb premetastaatilise nishi teke tahkes tuumoris. Premetastaatilise nish hõlmab endas hüpoksiliste tingimuste tekke tahkes kasvajas, kasvajarakkude epiteliaal-mesenhümaalse transformatsiooni (EMT) ning resistentsuse anoikis tüüpi raku surmale. Mitmetes erinevates kasvajatüüpides, s.h. neuroblastoomides, indutseeritakse retseptor türosiinkinaas TrkB ekspressioon vastuseks hüpoksiale. Kõrge TrkB ekspressioon neuroblastoomides on seotud kasvaja kõrge metastaatilise aktiivsusega. TrkB geen kodeerib mitmeid erinevaid isovorme tänu alternatiivsele splaissingule, erinevad isovormid aktiveerivad erinevaid rakusiseseid signaaliteid ning samuti võivad mõned TrkB isovormid signaalida ligand sõltumatult. TrkB üle-ekspressioon rakukultuuris on piisav, et indutseerida EMT ning resistentsus anoikisele. Samas ei ole selge, millised TrkB isovormid on selleks vajalikud. Antud granditaotluses välja pakutud katsetega kavatseme me identifitseerida, millised TrkB isovormid indutseeritakse kasvajarakkude vastuseks hüpoksiale ning millised isovormid on vajalikud EMT ja anoikise resistentsuse tekkeks. Me kasutame mitmeid erinevaid metoodikaid, et mõõta EMT-d ja anoikise resistentsust, s.h. erinevate EMT markerite mõõtmist, rakkude migratsiooni, agregatsiooni ja elunemuse mõõtmisi. Samuti uuritakse TrkB ligandi, BDNFi, vajalikust EMT induktsiooniks ja anoikise resistentsuse tekkeks. Samuti plaanime uurida, TrkB signaaliraja aktiveerimise seost teiste tuntud EMT-d indutseerivate signaalidega, nimelt Notch ja Sonic Hedgehog signaaliradadega, EMT induktsioonis ja anoikise resistentsuse tekkes. Meie tulemused lisavad teadmisi TrkB, Shh ning Notch signaaliradade osalusest neuroblastoomi rakkude metastaatilises käitumises.
Metastatic cascade is initiated by the establishment of pre-metastatic niche, involving generation of hypoxic conditions in the solid tumor, epithelial-mesenchymal transformation (EMT) of tumor cells and induction of anoikis resistance. Expression of receptor tyrosine kinase TrkB is induced under hypoxic conditions in a number of different cell types, including neuroblastoma cells. High expression of TrkB in neuroblastomas is associated with high metastatic activity of the tumor cells. TrkB gene codes for a number different isoforms due to alternative splicing. Specific TrkB isoforms initiate different intracellular signaling cascades and it is likely that some TrkB isoforms can signal in a ligand independent manner. It is not known, which isoforms are competent for EMT and anoikis resistance induction. Current grant proposal is aimed to identify function of different TrkB isoforms in the initiation of metastatic behaviour cancer cells. We will identify which TrkB isoforms are induced by hypoxic conditons and analyse the contribution of different isoforms in inducing EMT and resistance to anoikis. Variety of assays will be set up to measure EMT and resistance to anoikis, including measurement of different EMT markers, cell migration, aggregation and death. All assays will be performed in the presence and absence of BDNF, to investigate the ligand dependency of the specific isoform. Also, we will compare contribution of TrkB pathway to other known EMT inducing pathways, namely Shh and Notch, to understand, if these pathways cross-talk with each other in EMT induction. Results of these experiments will identify the contribution of TrkB, Shh and Notch signaling to the metastatic behaviour of neuroblastoma cells.
Antud grandi kestel saadi järgmised kõige olulisemad tulemused: 1) leiti, et NGFi kõrge afiinsusega retseptori TrkA ekspressioon tõuseb oluliselt roti neuronites hüpoksiliselt tingimustel. 2)leiti, et inimese rinnavähi rakuliin MDA-MB-231 ning inimese primaarsed adipotsüütidest pärinevad eellasrakud on sobivateks rakusüsteemideks uurimaks SHH signaaliraja molekulaarseid aspekte. 3) leiti, et SU6668 ja staurosporiin on ULK3 valgukinaasi madalmolekulaarsed inhibiitorid ja nende inhibitsioonimehhanism on kas osaliselt või täielikult sõltumatu ATP hulgast.