"ERMOS järeldoktori uurimistoetus" projekt ERMOS19
ERMOS19 "Lühikeste RNA geenide analüüs kasutades geeniregulatsiooni ja ekspressiooni andmeid (1.09.2010−31.08.2013)", Balaji Rajashekar, Tartu Ülikool, Tartu Ülikool, Matemaatika-informaatikateaduskond.
Lühikeste RNA geenide analüüs kasutades geeniregulatsiooni ja ekspressiooni andmeid
small RNAs : analysis of small RNAs using gene regulation and co-expression data
Teadus- ja arendusprojekt
ERMOS järeldoktori uurimistoetus
ValdkondAlamvaldkondCERCS erialaFrascati Manual’i erialaProtsent
4. Loodusteadused ja tehnika4.6. ArvutiteadusedP170 Arvutiteadus, arvutusmeetodid, süsteemid, juhtimine (automaatjuhtimisteooria)1.1. Matemaatika ja arvutiteadus (matemaatika ja teised sellega seotud teadused: arvutiteadus ja sellega seotud teadused (ainult tarkvaraarendus, riistvara arendus kuulub tehnikavaldkonda)50,0
1. Bio- ja keskkonnateadused1.12. Bio- ja keskkonnateadustega seotud uuringud, näiteks biotehnoloogia, molekulaarbioloogia, rakubioloogia, biofüüsika, majandus- ja tehnoloogiauuringudT490 Biotehnoloogia 1.5. Bioteadused (bioloogia, botaanika, bakterioloogia, mikrobioloogia, zooloogia, entomoloogia, geneetika, biokeemia, biofüüsika jt50,0
Tartu Ülikoolkoordinaator01.09.2010−31.08.2013
Tartu Ülikool, Matemaatika-informaatikateaduskondkoordinaator01.09.2010−31.08.2013
01.09.2010−31.08.20131 450 000,00 EEK (92 671,89 EUR)
92 671,89 EUR

Small regulatory RNAs (micro RNAs and small interfering RNAs) regulate gene expression during growth and development and initiate epigenetic changes to DNA and chromatin (Bartel 2009; Carthew and Sontheimer 2009). The main objective of this project is to identify the full complement of miRNAs and siRNAs in animals and plants by using bioinformatics, genomics, biochemistry, cell biology and genetics. Further to provide a perspective for the future our main aim will be to address and understand how these RNAs are produced and processed, how they are transported and how they target specific genes and RNAs for silencing. Expression of different short RNA and mRNA can reveal complex dynamic interplay between these molecules. The overall goal is to develop methods that would allow analysis of sRNA expression and linking of that to mRNA expression data analyses.