"Eesti Teadusfondi uurimistoetus" projekt ETF6533
ETF6533 "Arbuskulaar-mükoriisse kolonisatiooni kvantitatiivse dünaamika uurimise metoodika salumetsa alustaimestiku liikidel (1.01.2005−31.12.2008)", Maarja Öpik, Tartu Ülikool, Bioloogia-geograafiateaduskond, Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond.
ETF6533
Arbuskulaar-mükoriisse kolonisatiooni kvantitatiivse dünaamika uurimise metoodika salumetsa alustaimestiku liikidel
Methodology for the investigation of quantitative dynamics of arbuscular mycorrhizal colonization of boreo-nemoral forest understorey plant species
1.01.2005
31.12.2008
Teadus- ja arendusprojekt
Eesti Teadusfondi uurimistoetus
ETIS klassifikaatorAlamvaldkondCERCS klassifikaatorFrascati Manual’i klassifikaatorProtsent
1. Bio- ja keskkonnateadused1.4. Ökoloogia, biosüstemaatika ja -füsioloogiaB270 Taimeökoloogia 1.5. Bioteadused (bioloogia, botaanika, bakterioloogia, mikrobioloogia, zooloogia, entomoloogia, geneetika, biokeemia, biofüüsika jt50,0
1. Bio- ja keskkonnateadused1.4. Ökoloogia, biosüstemaatika ja -füsioloogiaB460 Füüsiline antropoloogia 1.5. Bioteadused (bioloogia, botaanika, bakterioloogia, mikrobioloogia, zooloogia, entomoloogia, geneetika, biokeemia, biofüüsika jt50,0
AsutusRollPeriood
Tartu Ülikool, Bioloogia-geograafiateaduskondkoordinaator01.01.2005−31.12.2007
Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskondkoordinaator01.01.2008−31.12.2008
PerioodSumma
01.01.2005−31.12.2005112 941,18 EEK (7 218,26 EUR)
01.01.2006−31.12.2006115 200,00 EEK (7 362,62 EUR)
01.01.2007−31.12.2007115 200,00 EEK (7 362,62 EUR)
01.01.2008−31.12.2008117 240,00 EEK (7 493,00 EUR)
29 436,50 EUR

Arbuskulaar-mükoriissete (AM) seente looduslikud kooslused on funktsionaalselt mitmekesised, ning varieeruvad ajas ja ruumis. AM seened kui levinud taimejuurte sümbiondid on olulised taimekoosluste struktuuri määrajatena, kuid nende kvantitatiivse dünaamika kohta on looduses vähe teada. Antud projektis kavatsetakse välja töötada AM seente reaalajas PCR-l põhinev molekulaarse kvantifitseerimise meetod, mis võimaldaks samast materjalist määrata ka seened ning hinnata nende suhtelisi ohtrusi taimejuurtes. Optimeeritud metoodikat rakendatakse salumetsa alustaimestiku AM seenekoosluste ruumilise ja ajalise dünaamika kvantitatiivseks kirjeldamiseks. Manipulatiivsetes potikatsetes testitakse uurimisalalt kultuuri viidud seente ning sama ala taimeliikide erinevate kombinatsioonide mõju sümbioosi poolte kasvuparameetritele, sh AM kolonisatsioonile, seda nii ühekaupa kombinatsioonides ning konkurentsi tingimustes, kus hinnatakse ka üksikute seeneliikide panus kolonisatsioonis. Projekti tulemusena väljatöötatud metoodika leiab eeldatavasti laia rakendust teiste mükoriisauurijate poolt. Projektis saadavad andmed võimaldavad paremini mõista AM seente looduslike koosluste struktuuri ja dünaamikat ning seente leviku seaduspärasusi. Projekti käigus eraldatavad seenekultuurid on oluline panus rahvusvahelistele seenekultuuride kollektsioonidele, kus nii boreaalne vöönd kui looduslikud kooslused on halvasti esindatud. Kultuurid on oluline alusmaterjal nii edasipidisteks funktsionaalseteks uuringuteks kui kommertsinokulumide väljatöötamiseks põllumajanduse, aianduse ja maastikuplaneerimise tarbeks.
Natural communities of arbuscular mycorrhizal (AM) fungi are known to be functionally diverse and to vary both in time and space. AM fungi as widespread root symbionts are have essential determiners of plant community structure; however, information is scarce regarding their quantitative dynamics in the nature. This project intends to develop a method for molecular quantification of AM fungi based on real-time PCR; this method would allow concurrent identification of fungi in the same sample and estimation of their relative abundance in plant roots. The optimized methodology will be applied to describe the spatial and temporal quantitative dynamics of the AM fungal communities associated with a boreo-nemoral forest understorey plants. Manipulative experiments will be lead to test the effect of plant and fungus combination, both originating from the same forest site, on performance of symbiotic partners, including AM colonization, in one-to-one combinations and in conditionsof competition. The methodology developed as a result of the project is expected to find wide use by mycorrhiza researchers. The information obtained through the project will further the understanding on the structure and dynamics of the natural communities of AM fungi and on their distribution. The AM fungal isolates obtained in the project comprise an important contribution to the international culture collections of AM fungi, where boreal zone and natural (untouched) communities are poorly represented. These are also extremely important material for functional research in the future as well as for commercial inoculum development with applications in agriculture, ornamental plant production and landscaping.