Teadus- ja innovatsioonipoliitika seire programmi lähtealuseks on Inimressursi arendamise rakenduskava 2007–2013 ning Eesti teadus- ja arendustegevuse ning innovatsiooni strateegia 2007−2013 "Teadmistepõhine Eesti" (edaspidi TA&I strateegia). Programmi neljas seirevaldkond käsitleb ettevõtete ja kõrgkoolide koostöö juhtimise küsimusi. Eesti ettevõtete ja kõrgkoolide innovatsiooni-, haridusalane jm koostöö tase on rahvusvahelises võrdluses madal. Ettevõtete ja kõrgkoolide koostöö paremaks juhtimiseks on oluline teada, missugustest teguritest lähtuvalt koostööd planeeritakse ja realiseeritakse, kuivõrd arvestatakse vastastikuse eripäraga, kuivõrd ülikooli organisatsioonikultuur mõjutab koostööd äriettevõtetega, samuti haruliitude ja teiste teadmust suunavate (valitsus)organisatsioonidega jne. Ettevõtete ja kõrgkoolide koostöö arendamiseks on vajalik pidev seire teadmuse loomise, levitamise, ühiskonnaga/ettevõtetega suhestumise ja nende kaasamise protsessidest lähtuvalt. Selline lähenemisviis sisaldab endas väga laia spektri tegevuste dünaamilist analüüsi (alustades koolitusest ja lõpetades tehnoloogilise infrastruktuuri ühiskasutusega, samuti spin-off ettevõtete loomisega), samuti vastavate teaduspoliitika meetmete mõju analüüsi ja sellest tulenevaid ettepanekuid. Koostöö paremaks juhtimiseks regionaalsel tasandil on oluline analüüsida väljaspool suurlinnu paiknevate kõrgharidusasutuste rolli regionaalse innovatsioonisüsteemi raamistikus paralleelselt teiste teadmussiirde asutustega (maakondlikud arenduskeskused, äriteenuste pakkujad jne) ning hinnata nende koostoimet kohalike- ja regionaalsete võimude ning ettevõtlusorganisatsioonidega ning mõju regionaalarengule. Seirevaldkonna raames viiakse perioodil 2011-2015 läbi viis erinevat uuringut.