See veebileht kasutab küpsiseid kasutaja sessiooni andmete hoidmiseks. Veebilehe kasutamisega nõustute ETISe kasutustingimustega. Loe rohkem
Olen nõus
"Sihtfinantseerimine" projekt SF0182582As03
SF0182582As03 "Inimese Genoom II (1.01.2003−31.12.2007)", Andres Metspalu, Tartu Ülikool, Bioloogia-geograafiateaduskond.
SF0182582As03
Inimese Genoom II
Human Genome II
1.01.2003
31.12.2007
Teadus- ja arendusprojekt
Sihtfinantseerimine
ValdkondAlamvaldkondCERCS erialaFrascati Manual’i erialaProtsent
1. Bio- ja keskkonnateadused1.3. GeneetikaB220 Geneetika, tsütogeneetika 1.5. Bioteadused (bioloogia, botaanika, bakterioloogia, mikrobioloogia, zooloogia, entomoloogia, geneetika, biokeemia, biofüüsika jt25,0
3. Terviseuuringud3.1. BiomeditsiinB100 Biomeditsiini ajalugu ja filosoofia, teoreetiline bioloogia, evolutsiooni üldised küsimused 3.1. Biomeditsiin (anatoomia, tsütoloogia, füsioloogia, geneetika, farmaatsia, farmakoloogia, kliiniline keemia, kliiniline mikrobioloogia, patoloogia)50,0
4. Loodusteadused ja tehnika4.16. Biotehnoloogia (loodusteadused ja tehnika)P515 Geodeesia 2.1. Ehitusteadused (ehitusprojekteerimine, ehitustehnika, tööstus- ja tsiviilehitus ning teised seotud teadused)25,0
AsutusRollPeriood
Tartu Ülikool, Bioloogia-geograafiateaduskondkoordinaator01.01.2003−31.12.2007
PerioodSumma
01.01.2003−31.12.2003773 000,00 EEK (49 403,70 EUR)
01.01.2004−31.12.2004975 000,00 EEK (62 313,86 EUR)
01.01.2005−31.12.2005950 000,00 EEK (60 716,07 EUR)
01.01.2006−31.12.20061 146 000,00 EEK (73 242,75 EUR)
01.01.2007−31.12.20071 296 000,00 EEK (82 829,50 EUR)
328 505,88 EUR

Projekt keskendub inimese genoomi alusuuringutele eesmärgiga koostada Eesti populatsiooni detailne iseloomustus koos LD kaardiga. Saadav informatsioon leiaks kohe kasutamist Geenivaramu projektis. Lisaks uurime geeniekspressiooni ja valkude sünteesi nii, et oleks võimalik lõpuks öelda, kuidas geneetilised markerid (SNP-d) on seotud mRNA ekspressiooniga ja sealt edasi valkude ekspressiooniga. Neid tulemusi saab kasutada ravimuuringutes. Põhilised meetodid, mida me kasutame nende eesmärkide saavutamiseks on: genotüpiseerimise tehnoloogia mikrokiibil (APEX kuni 60 000 markerini), mRNA ekspressioonianalüüs (cDNA mikrokiibid, kuni 35 000 cDNA-d) ja valkude analüüs (kromatograafia, 2-D elektroforees (aparatuur olemas), MALDI-TOF (koostöös) ja valgu mikrokiibid (juurutame ise). Võrdleva genoomika raames töötame hiire genoomiga, analüüsides nii kandidaatgeene haigustele kui ka K/O hiirte geeniekspressiooni võrdluses normaalsetega. Uue tehnoloogiana juurutame mikrokiipide in situ sünteesi, kasutades Febit tehnoloogiat. Eesti DNA proovid tulevad Geenivaramust, võrdlusmaterjal (Aasia, Aafrika, muu Euroopa) koostööpartneritelt. Kogu projekt eeldab tugevat bioinformaatika-alast toetust, mis on olemas.
The project is focused on fundamental studies of the human genome with the main goal to accomplish detailed genetic description of the Estonian population together with LD map. This information can be used in EGP immediately. In addition, we will study gene expression and protein synthesis in such a way that makes it possible to relate it to the SNP marker information. These analytical data can be used in drug development. The basic methods we are going to use to achieve these goals are: genotyping using APEX micro arrays (up to 60 000 SNPs), cDNA expression analysis on micro arrays (up to 35 000 cDNAs) and protein analysis (chromatography, 1-D and 2-D electrophoresis, MALDI-TOF and protein micro arrays). Comparative genomics will be used to compare mouse and human genomes in order to find new candidate genes involved in regulatory pathways and diseases and to generate K/O mice as disease models to prove the hypotheses. As a new technology, we will implement in situ oligonucleotide array synthesis using Febit approach. Estonian DNA samples will come from the EGP, the rest (Asian, African, Europe) through our collaborations. This project needs strong input of bioinformatics, which we have at hand, but need to develop further.