"Eesti Teadusfondi uurimistoetus" projekt ETF5939
ETF5939 (ETF5939) "Post-transkriptsiooniline geenivaigistamine ja selle suppressorid (1.01.2004−31.12.2007)", Erkki Truve, Tallinna Tehnikaülikool, Matemaatika-loodusteaduskond.
ETF5939
Post-transkriptsiooniline geenivaigistamine ja selle suppressorid
Post-transcriptional gene silencing and its suppressors
1.01.2004
31.12.2007
Teadus- ja arendusprojekt
Eesti Teadusfondi uurimistoetus
ValdkondAlamvaldkondCERCS erialaFrascati Manual’i erialaProtsent
1. Bio- ja keskkonnateadused1.12. Bio- ja keskkonnateadustega seotud uuringud, näiteks biotehnoloogia, molekulaarbioloogia, rakubioloogia, biofüüsika, majandus- ja tehnoloogiauuringudB434 Agrokeemia 1.5. Bioteadused (bioloogia, botaanika, bakterioloogia, mikrobioloogia, zooloogia, entomoloogia, geneetika, biokeemia, biofüüsika jt100,0
PerioodSumma
01.01.2004−31.12.2004100 000,00 EEK (6 391,16 EUR)
01.01.2005−31.12.2005100 000,00 EEK (6 391,16 EUR)
01.01.2006−31.12.2006102 000,00 EEK (6 518,99 EUR)
01.01.2007−31.12.2007104 520,00 EEK (6 680,05 EUR)
25 981,36 EUR

Projekti esimene eesmärk on iseloomustada PTGS-i suppressoreid taimeviiruste perekonnast Sobemovirus ning vähemal määral perekonnast Potyvirus. Uurime ka nimetatud suppressorite muid funktsioone viiruse elutsüklis. Teiseks soovime me kindlaks teha peremeesraku komponente, milliseid on vaja PTGS-iks. Selleks on meil kavas kasutada erinevaid molekulaarseid meetodeid nagu bakteri ja pärmi kaksikhübriide, koimmunopretsipitatsioone ning muid meetodeid eesmärgiga identifitseerida rakulisi komponente, millised interakteeruvad PTGS-i suppressoritega. Taoliste kogu genoomi (õigemini küll proteoomi) hõlmavate skriiningute kõrval soovime lähemalt analüüsida mõnede konkreetsete taimevalkude võimalikku rolli PTGS-is. Nimetatud valgud omavad kõrget homoloogiat imetajate RNA degradatsiooni põhjustava 2-5A rajaga
The first objective of the proposed project is to characterize viral suppressors of PTGS from plant virus genus Sobemovirus and to a lesser extent from genus Potyvirus. We plan also to analyse other functions of these named suppressors during the virus life cycle. The second objective of the project is the identification of host factors required for PTGS. For that we plan to exploit the molecular approach by using bacterial and yeast two hybrid systems, co-immunoprecipitations (IPs) and other techniques to identify host components interacting with the suppressors of PTGS. Besides these genome-wide screening approaches it is planned to focus more specifically on the potential role in gene silencing of some plant proteins homologous to animal RNA-degrading 2-5A system