An open source software package for automated extraction of ITS1 and ITS2 from fungal ITS sequences for use in high-throughput community assays and molecular ecology

Kirje

Nilsson, R.H.; Veldre, V.; Hartmann, M.; Unterseher, M.; Amend, A.; Bergsten, J.; Kristiansson, E.; Ryberg, M.; Jumpponen, A.; Abarenkov, K. (2010). An open source software package for automated extraction of ITS1 and ITS2 from fungal ITS sequences for use in high-throughput community assays and molecular ecology. Fungal Ecology, 3 (4), 284−287. DOI: 10.1016/j.funeco.2010.05.002.

Publikatsiooni tüüp

artikkel ajakirjas

Autorid, kellel on ETISe konto

Autorid

Kui väljale „Autorid, kelle on ETISE konto“ sai lisada ainult neid isikuid, kes on ETISe kasutajad, siis väljale „Autorid“ tuleks sisestada kõigi publikatsiooni autorite nimed formaadis "Perenimi, Eesnimi" või "Perenimi, E.". Mitu nime tuleks eraldada semikooloniga. Nimed tuleks jätta sellisele kujule nagu nad on publikatsiooni originaalis ja seda isegi juhul, kui mõne autori nimi on muutunud (nt abiellumise tõttu). Publikatsioonide otsing otsib nimesid nii väljalt "Autorid, kelle on ETISE konto" kui "Autorid" sisust. Kui seotud isik on toimetaja või koostaja, siis tuleks siia reale sisestada tema nimi ning lisaks ka ttegevuse lühend, nt "Perenimi, Eesnimi (Toim.)"

Nilsson, R.H.; Veldre, V.; Hartmann, M.; Unterseher, M.; Amend, A.; Bergsten, J.; Kristiansson, E.; Ryberg, M.; Jumpponen, A.; Abarenkov, K.

Keeled

Inglise

Ajakiri / jätkuväljaanne

Fungal Ecology

ISSN

1754-5048

Köide

Välja inglisekeelne vaste on "Volume".

Number

Ilmumisaasta

2010

Leheküljed

284–287

Staatus

Ilmumas publikatsioonide all peetakse silmas neid, mis on väljaandesse või kogumikku vastu võetud (accepted, in press), ent toimetamise või trükiprotsess on veel pooleli. Ilmumas staatusega publikatsioonide puhul on kohustuslik lisada publikatsiooni andmetesse kas DOI või fail, mis sisaldab toimetaja kinnituskirja publikatsiooni ilmumise kohta.

Ilmunud

Klassifikatsioon

1.1. Teadusartiklid, mis on kajastatud Web of Science andmebaasides Science Citation Index Expanded, Social Sciences Citation Index, Arts & Humanities Citation Index, Emerging Sources Citation Index ja/või andmebaasis Scopus (v.a. kogumikud)

Open Access

Klassifikatsiooni täpsustus

WOS

Viited terviktekstile

DOI

DOI, s.o rahvusvaheline digitaalse objekti identifikaator, mis peaks olema kas formaadis "http://dx.doi.org/10.0004545" või "http://doi.org/10.0004545". Välja täitmine on väga soovitatav, sest see loob lingi publikatsiooni orignaaltekstile. DOI-linki kuvatakse ka ETISe publikatsiooni lühikirjes.

doi.org/10.1016/j.funeco.2010.05.002

Seotud asutused

Asutused

Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Ökoloogia- ja Maateaduste Instituut, Mükoloogia õppetool

Lisainfo

Imporditud märksõnad

Environmental sampling, ITS, Molecular ecology, Nuclear ribosomal genes, Sequence identification

Projektid

SF0180153s08 "Mükoriisat ja samblikke moodustavate seente ökoloogia, taksonoomia ning biogeograafia spetsiifilised ja integreeritud küsimused. (1.01.2008−31.12.2013)", Urmas Kõljalg, Tartu Ülikool, Loodus- ja tehnoloogiateaduskond, Tartu Ülikooli Ökoloogia- ja Maateaduste Instituut.

Loobu

Eesti Teadusinfosüsteem

An open source software package for automated extraction of ITS1 and ITS2 from fungal ITS sequences for use in high-throughput community assays and molecular ecology

Viited terviktekstile

Seotud asutused

Lisainfo